Bohater gry Escape the Giant School 3D nagle stał się bardzo mały, trafiając do szkoły, która stała się dla niego gigantyczna. Zwykłe książki, ołówki i gumka stały się przeszkodą na drodze chłopca, który chce szybko opuścić niebezpieczną szkołę. Pomóż mu pokonać przeszkody w postaci ogromnych artykułów piśmiennych, podręczników i innych przedmiotów, z których zwykle korzysta uczeń. Przeskakuj gumki i ołówki, książki i biurka, docierając do mety, aby przenieść się do nowej lokalizacji w Escape the Giant School 3D.