Po serii katastrof spowodowanych przez człowieka ekologia planet znacznie się pogorszyła, a życie ludzi stało się trudne. Pojawiły się mutanty, które szybko przystosowały się do nowych warunków. Ich krew może stać się podstawą do stworzenia szczepionki, która pomoże zwykłym ludziom stać się silniejszymi i zdrowszymi. Bohaterem gry Mutant Blood jest światowej sławy naukowiec, który zjednoczył wszystkie mądre głowy na planecie, aby stworzyć szczepionkę. Prace rozpoczęły się we wszystkich tajnych laboratoriach, ale pojawili się ci, którzy chcą ingerować w proces w Mutantblood – są to ekstremiści.
