Bohaterem gry Dark Dino Runner jest pikselowy dinozaur. Chce znaleźć schronienie, aby przetrwać epokę lodowcową. Najbardziej niezawodne są jaskinie w górach, ale trzeba się do nich dostać. Ścieżka wiedzie przez pustynię, jednak w ciągu dnia panuje tam piekielny upał i dinozaur nie będzie w stanie przebiec nawet kilometra bez omdlenia ze zmęczenia. Dlatego bohater zdecydował się kontynuować swoją podróż nocą, gdy nie było jeszcze gorąco. W nocy na pustyni jest zimno, więc dinozaur będzie biegł szybciej, aby się ogrzać, a ty pomożesz mu przeskoczyć ogromne kaktusy, które spotkają po drodze w grze Dark Dino Runner.