Aby wygrać grę Heart of the Samurai trzeba przebrnąć przez 8 poziomów pełnych niebezpiecznych wrogów i zniszczyć ich przywódcę, który uczynił wiele zła na tym świecie. Aby zniszczyć wrogów będziesz miał miecz samurajski i rzucania lotkami, że zawsze dzieje się znaleźć w grze.